Bacteriófagos: los cazadores del intestino

Los virus que solo infectan bacterias están entre las entidades más numerosas del intestino. Qué hacen allí.

¿Qué tan sólida es la investigación? Plausible

Que los fagos ayudan a regular el microbioma está bien documentado en laboratorio y en modelos animales. En personas, la investigación aún es joven: hay estudios observacionales y unos pocos ensayos controlados pequeños.

Estado saludable

Los Bacteriófagos Virus que solo infectan bacterias. En el intestino hay probablemente tantos fagos como bacterias, quizá más, y ayudan a decidir qué bacterias se imponen. , o fagos, son virus que infectan exclusivamente bacterias. No pueden infectar células humanas. Son la mayor parte del “viroma”, el conjunto de todos los virus del intestino. Por gramo de heces hay probablemente miles de millones de partículas víricas, aproximadamente tantas como bacterias, quizá más. La cifra citada a menudo de “diez veces más fagos que bacterias” se considera obsoleta, y los números varían según el método de medición. También hay virus que infectan hongos, amebas y células humanas, pero son minoría.

La mayor parte de estos fagos sigue siendo desconocida: en la mayoría de los hallazgos genéticos no se puede decir qué bacteria infectan. Los expertos hablan de “materia oscura”. Se sabe, por ejemplo, que los llamados fagos de tipo crAss, que infectan especies de Bacteroides, son muy frecuentes en muchas personas. En los humanos, el viroma se forma en los primeros años de vida junto con las bacterias. La alimentación, la edad y el lugar de residencia lo moldean después.

Llama la atención lo personal y estable que es. En un estudio que siguió a adultos sanos durante meses y hasta más de dos años, cada persona tenía un “núcleo” propio de fagos que se mantuvo notablemente constante. Casi ningún fago aparecía en la mayoría de los participantes. Como con la huella bacteriana, no hay una única imagen sana de fagos, sino muchas.

Cada fago está especializado en ciertas bacterias. Si una especie se hace más frecuente, sus fagos encuentran más presas y pueden limitarla para que ninguna especie se vuelva demasiado poderosa. Este principio se conoce como “depredador y presa”: las cifras de ambos lados fluctúan sin que la presa se extinga, porque las bacterias cambian continuamente su superficie para escapar de los fagos y tienen sus propios sistemas de defensa (el más conocido es CRISPR). Esta carrera armamentística mantiene alta la diversidad. Cuánto actúa en el intestino humano sigue sin estar claro, porque la mayoría de las pruebas proceden del laboratorio y de modelos animales.

Muchos fagos viven además en silencio en el genoma de sus bacterias y se multiplican solo con ellas (fagos “dormidos” o atemperados). En un intestino sano, la relación es más bien de convivencia. Hallazgos de laboratorio indican también que los fagos pueden adherirse al moco intestinal y así vigilar el límite con la pared intestinal, donde las bacterias podrían ser especialmente peligrosas. Pequeñas cantidades de fagos también se absorben y se encuentran dentro del cuerpo. Si esto importa para el sistema inmunitario es una cuestión abierta.

Los fagos cazan a la especie más común; otros reposan en el genoma de sus bacterias.

Estado alterado: causas y consecuencias

El estrés para las bacterias, por ejemplo por antibióticos, inflamación o estrés oxidativo (compuestos agresivos del oxígeno), puede despertar fagos dormidos. El principio: el daño al genoma desencadena en la bacteria una respuesta de emergencia, y los fagos dormidos en su genoma la usan como señal para multiplicarse y hacer estallar la célula. Así pueden destruir muchos huéspedes a la vez y desplazar la Microbioma, microbiota intestinal La comunidad de todos los microbios del intestino, sobre todo bacterias, además de virus, hongos y arqueas. La mayoría vive en el colon. Más en el capítulo «Construir diversidad microbiana» sin que llegue ningún germen nuevo de fuera.

En las Enfermedad inflamatoria intestinal Término que agrupa la enfermedad de Crohn y la colitis ulcerosa: inflamaciones crónicas del intestino, con brotes, que necesitan tratamiento médico. Más en el capítulo «Sistema inmunitario e inflamación», la comunidad de fagos está claramente alterada. En un estudio, un grupo concreto de fagos (Caudovirales) estaba aumentado en la enfermedad de Crohn y la colitis ulcerosa aunque la diversidad bacteriana descendía al mismo tiempo, de modo que el cambio no se explicaba solo por más presas. La comunidad también está alterada en el cáncer colorrectal y la cirrosis hepática. Si es causa o consecuencia no está claro. Ambas cosas son concebibles: la inflamación despierta fagos, y los fagos podrían avivar la inflamación al hacer estallar bacterias. Por ahora es una hipótesis.

Los fagos también pueden transferir genes entre bacterias. Ejemplos conocidos son las toxinas: los genes de la toxina Shiga de ciertas cepas de E. coli y de la toxina del cólera los portan fagos. También los genes de resistencia pueden transmitirse así, pero en el intestino esto probablemente ocurre con menos frecuencia que en el medio ambiente. Para personas sanas no es motivo de preocupación en la vida diaria.

Los antibióticos no solo cambian las bacterias, sino también los virus que dependen de ellas. Tras un tratamiento, el patrón de fagos se desplaza y pueden pasar meses hasta que se estabiliza de nuevo. Un trasplante de heces transfiere virus junto con las bacterias. En las infecciones recurrentes por Clostridioides difficile Una bacteria que puede extenderse tras los antibióticos y causar diarrea grave con sus toxinas. Más en el capítulo «Tras los antibióticos: C. difficile y el trasplante fecal» esto es una posible parte de su efecto. Se considera un indicio, no algo demostrado.

Es importante poner esto en perspectiva: los virus son difíciles de medir, los métodos difieren de un estudio a otro y gran parte de las secuencias no se puede asignar a ningún fago. Afirmaciones como “los fagos X son buenos” o “los fagos Y enferman” no son posibles hoy para individuos. En consecuencia, las pruebas comerciales del viroma no son significativas.

El estrés despierta a los fagos en reposo: se multiplican y las bacterias revientan.

Lo que suele ayudar

Estilo de vida

Alimentación, ejercicio, sueño, relaciones sociales y manejo del estrés.

Estabilizar la microbiota en su conjunto Los fagos siguen a sus bacterias huésped. La alimentación, la edad y el lugar de residencia moldean la comunidad de fagos. Una microbiota diversa sostiene también un ecosistema de fagos diverso. Las mejores palancas son por tanto las mismas que para las bacterias: una dieta variada y rica en vegetales, con fibra. Experimental Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [1][2]
Alimentos fermentados Los fermentados contienen, además de bacterias, sus fagos. Si esto importa para el intestino aún no se ha estudiado. Experimental Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto.
Antibióticos solo cuando hagan falta Los antibióticos someten a las bacterias a estrés y pueden despertar fagos dormidos. Cuando son necesarios, tómalos según la prescripción. No sirven contra infecciones víricas como el resfriado o la gripe. Prometedor Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [1]

Suplementos naturales

Los suplementos no sustituyen una consulta médica. Comenta la dosis y las interacciones con tu médico o farmacéutico.

Preparados de fagos Un preparado con fagos contra E. coli redujo la cantidad de E. coli en las heces de personas sanas en un pequeño estudio cruzado y se toleró bien. En un segundo estudio, junto con un probiótico, hubo indicios de mejor bienestar y más bacterias beneficiosas. No está demostrado un beneficio claro para las molestias. Plausible Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [3][4]
No para hinchazón ni intestino irritable Los preparados de fagos no se han estudiado para el intestino irritable ni para la hinchazón. No deberían usarse para “optimizar el viroma”, porque no existe un valor objetivo. Experimental Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto.

Tratamientos médicos

Información, no una recomendación de tratamiento. Decide junto con un médico. La autorización y la disponibilidad varían según el país.

Terapia con fagos En infecciones por gérmenes resistentes, centros especializados usan fagos de forma dirigida. En muchos países, por ahora solo es posible como tratamiento individual. Infórmate de qué opciones existen en tu país. Plausible Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [5]
Fagos en el trasplante fecal En un trasplante fecal también se transfieren fagos. Los primeros estudios pequeños sugieren que podrían contribuir a su éxito. Experimental Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [6]
Sin pruebas del viroma sin una pregunta clara No existe un procedimiento reconocido para derivar un diagnóstico o un tratamiento de los virus en las heces. Si tienes molestias, hazte primero las exploraciones habituales. Experimental Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto.

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Cómo valoramos la evidencia

Nivel de confianza 5 de 5:Consolidado: Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas.
Nivel de confianza 4 de 5:Bien respaldado: Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes.
Nivel de confianza 3 de 5:Prometedor: Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes.
Nivel de confianza 2 de 5:Plausible: Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias.
Nivel de confianza 1 de 5:Experimental: Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto.

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