Bactéries sporulées : Bacillus et compagnie comme probiotiques

Comment les probiotiques sous forme de spores survivent à l'acide gastrique, ce qu'ils font dans l'intestin et où s'arrêtent les preuves.

Quelle est la solidité de la recherche ? Plausible

Il est démontré chez l'humain que les spores survivent à l'estomac et deviennent brièvement actives dans l'intestin. Des preuves existent pour quelques souches : Bacillus coagulans Unique IS2 dans l'intestin irritable et Bacillus clausii dans la diarrhée de l'enfant, avec un petit effet. La plupart des autres produits et usages sont à peine étudiés.

État sain

Certaines bactéries peuvent se transformer en spores : une forme de repos au noyau déshydraté et à l'enveloppe épaisse, qui résiste à la chaleur, à la sécheresse, à l'oxygène et à l'acide. Comme Probiotiques Des micro-organismes vivants censés apporter un bénéfice en quantité suffisante. L’effet dépend de chaque souche. Plus dans le chapitre « Bien utiliser les aliments fermentés », on utilise surtout Bacillus subtilis, Bacillus coagulans (aujourd'hui Heyndrickxia coagulans), Bacillus clausii (aujourd'hui Alkalihalobacillus clausii) et Clostridium butyricum. Bacillus subtilis se trouve aussi dans le natto japonais. Une différence entre les groupes : les Bacillus supportent l'oxygène, tandis que les clostridies sont Anaérobies Bactéries qui vivent sans oxygène. Pour les anaérobies strictes, l’oxygène est même toxique ; elles représentent la grande majorité de la flore intestinale. Plus dans le chapitre « Bactéries intestinales anaérobies : pourquoi les bonnes ne tiennent pas dans une gélule » et ont besoin d'un milieu pauvre en oxygène (plus dans le chapitre sur les bactéries anaérobies).

L'avantage : les spores survivent au stockage et à l'acide gastrique bien mieux que les bactéries lactiques. Dans l'intestin grêle, une partie des spores germe. Le déclencheur, ce sont des nutriments comme les acides aminés et les sucres, chez certaines espèces aussi les Acides biliaires Des substances produites par le foie pour rendre les graisses digestes. Environ 95 pour cent sont récupérés dans la dernière partie de l’intestin grêle ; les bactéries transforment le reste. Plus dans le chapitre « Acides biliaires : quand la bile donne la diarrhée ». Les bactéries deviennent actives, se multiplient brièvement et fabriquent des enzymes, des vitamines et des substances contre les agents pathogènes. Puis elles poursuivent leur route. Après une seule prise de Bacillus clausii, des chercheurs ont retrouvé les bactéries vivantes dans les selles jusqu'à douze jours, chez certaines personnes en plus grand nombre qu'avalées. Elles se multiplient donc dans l'intestin sans s'y installer durablement.

Les spores ne sont pas qu'une astuce des compléments. Une grande part des bactéries propres du côlon, dont de nombreuses productrices de Butyrate Un acide gras à chaîne courte et la principale source d’énergie des cellules de la paroi du côlon. Il renforce la barrière et freine l’inflammation. Plus dans le chapitre « Le butyrate et les autres acides gras à chaîne courte » du groupe des clostridies, forment elles-mêmes des spores. Cela les aide à survivre hors du corps et à passer à d'autres personnes. Cela explique aussi pourquoi certaines de ces bactéries peuvent mieux traverser une cure d'antibiotiques que leurs cousines sensibles. Chez la souris, certaines clostridies ont favorisé la formation de cellules immunitaires apaisantes ; chez l'humain, on ne sait pas si c'est pareil.

Un mécanisme bien étudié : les Bacillus fabriquent des fengycines. Ces substances perturbent le système de signaux par lequel Staphylococcus aureus se coordonne. Dans une étude en Thaïlande, les personnes dont les selles contenaient des Bacillus n'avaient pas de Staphylococcus aureus dans l'intestin.

Clostridium butyricum peut former du butyrate, le principal carburant des cellules de la muqueuse du côlon. La souche CBM588 est utilisée au Japon depuis des décennies. Dans une petite étude ouverte auprès de 30 personnes atteintes d'un cancer du rein, celles qui l'ont reçue en plus de l'immunothérapie ont vécu plus longtemps sans progression de la maladie (12,7 contre 2,5 mois). Des études plus larges devront montrer si cela se confirme.

La spore survit à l'acide gastrique, germe dans l'intestin, devient brièvement active puis poursuit sa route.

État perturbé : causes et conséquences

L'effet dépend de la souche, pas de l'espèce. Une Méta-analyse Une analyse qui combine les résultats de plusieurs études. Elle ne vaut que ce que valent les études qu’elle inclut. d'essais contrôlés contre Placebo Un faux traitement sans principe actif. La comparaison avec lui montre ce qu’un remède apporte au-delà de l’attente et du hasard. a trouvé dans l' Syndrome de l’intestin irritable Des douleurs abdominales récurrentes liées aux selles, sans que les examens trouvent une autre cause. On le comprend aujourd’hui comme un trouble de l’interaction intestin-cerveau. Plus dans le chapitre « L’axe intestin-cerveau » des preuves pour Bacillus coagulans Unique IS2 et une meilleure qualité de vie avec la souche MTCC 5856. Cela ne vaut pas automatiquement pour d'autres souches. Beaucoup de produits ne nomment que l'espèce, pas la souche. S'y ajoute la qualité : pour les probiotiques en général, il a été rapporté que l'espèce, la souche ou le nombre de germes du produit peuvent différer de l'étiquette.

Bacillus clausii a raccourci la diarrhée aiguë de l'enfant d'environ neuf heures dans six essais. C'est peu. Les gastro-entérologues américains déconseillent même, en Amérique du Nord, les probiotiques de façon générale dans la gastro-entérite aiguë de l'enfant. Dans l'intestin irritable, ils ne voyaient en 2020 pas de preuves suffisantes pour les probiotiques en général.

Les spores ne sont pas bonnes par nature. Parmi les formeurs de spores, il y a aussi des agents pathogènes : Clostridioides difficile Une bactérie qui peut se répandre après des antibiotiques et provoquer une diarrhée sévère par ses toxines. Plus dans le chapitre « Après les antibiotiques : C. difficile et la transplantation fécale » (diarrhée après antibiotiques), Clostridium perfringens, Bacillus cereus (vomissements et diarrhée après du riz gardé longtemps au chaud) et la bactérie du botulisme. Les souches probiotiques sont donc vérifiées pour s'assurer qu'elles ne portent pas de gènes de toxines. Cela vaut pour les souches testées, pas pour n'importe quelle poudre contenant des bactéries du sol. La robustesse qui rend les spores utiles comme probiotique les rend difficiles à éliminer comme contamination des aliments.

Les probiotiques ne sont pas toujours anodins. Dans une petite étude sans groupe témoin, 30 personnes souffrant d'étourdissement et de ballonnements avaient toutes pris des probiotiques ; beaucoup avaient une Pullulation bactérienne de l’intestin grêle (SIBO) Trop de bactéries dans l’intestin grêle, où peu vivent normalement. Ballonnements et diarrhée sont typiques ; on la diagnostique en général par un test respiratoire. Plus dans le chapitre « Quand l’intestin grêle est trop colonisé » de l'intestin grêle et de l'acide D-lactique dans les urines. Le mécanisme : dans une pullulation, les bactéries de l'intestin grêle fermentent le sucre en acide lactique, y compris sous la forme D, que l'humain ne sait presque pas dégrader. Il passe dans le sang et peut provoquer un état de brouillard. Si la vague de nettoyage entre les repas (le CMM) est faible, ou si le muscle de fermeture entre l'intestin grêle et le côlon, la valve iléo-cæcale, laisse remonter des bactéries du côlon, cela se produit plus facilement. Après l'arrêt et une cure d'antibiotiques, la plupart allaient mieux. Les spores qui germent dans l'intestin grêle ne sont pas exemptées de ce risque.

Chez les personnes gravement malades, avec un cathéter veineux ou une immunité très affaiblie, la prudence s'impose pour tous les probiotiques vivants, car ils peuvent rarement passer dans le sang. Cela concerne surtout les prématurés, les personnes âgées malades et les personnes sous chimiothérapie. Les personnes en bonne santé courent à peine ce risque. Quand un produit est pris avec un antibiotique : les spores sont de toute façon moins sensibles aux antibiotiques, et certains produits utilisent en outre des souches résistantes à certains antibiotiques. Cela dépend de la souche et ne vaut pas pour toutes.

L'effet n'est prouvé que pour les souches étudiées. Beaucoup de produits n'indiquent que l'espèce.

Ce qui aide souvent

Mode de vie

Alimentation, activité physique, sommeil, liens sociaux et gestion du stress.

Natto et autres sources de spores dans l'alimentation Le natto contient des spores vivantes de Bacillus subtilis. La terre sur les légumes apporte aussi des formeurs de spores. Si cela apporte quelque chose pour la santé est à peine étudié, mais cela ne nuit pas aux personnes en bonne santé. Le natto est riche en vitamine K et peut gêner les anticoagulants comme la warfarine ; si tu en prends, parles-en d'abord à ton cabinet. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte.
Ne pas laisser le riz et les plats cuits au chaud Bacillus cereus survit à la cuisson sous forme de spore et se multiplie quand le riz ou les pâtes restent chauds pendant des heures. Refroidir vite, mettre au réfrigérateur et ne réchauffer qu'une fois. C'est l'envers des spores et cela n'a rien à voir avec les probiotiques. Bien étayé Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte.

Compléments naturels

Les compléments ne remplacent pas un bilan médical. Parle du dosage et des interactions avec ton médecin ou ton pharmacien.

Dans l'intestin irritable : regarder la souche Si tu veux essayer, choisis une souche testée en études, comme Bacillus coagulans Unique IS2 ou MTCC 5856. Teste quatre à huit semaines, note tes troubles et arrête sans amélioration nette. Prometteur Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [1]
En cas de diarrhée aiguë chez l'enfant Bacillus clausii peut raccourcir la diarrhée de quelques heures. Boire et compenser les sels compte davantage. Les sociétés savantes ne sont pas d'accord sur les probiotiques chez l'enfant. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [2][3]
Les spores se conservent bien, mais ne sont pas une solution durable Les spores ne s'installent pas durablement. Leur effet s'arrête peu après l'arrêt. Les fibres et la diversité végétale nourrissent ta propre flore plus durablement. Prometteur Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [4]
Lire l'étiquette Un produit utilisable indique le genre, l'espèce et la souche, le nombre de germes en fin de durée de conservation et la durée pour laquelle il a été testé. Sans la souche, on ne peut pas vérifier si elle a jamais été étudiée. Méfie-toi des promesses miracles. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte.

Traitements médicaux

Information, pas une recommandation de traitement. Décide avec un médecin. L’autorisation et la disponibilité varient selon les pays.

Prendre au sérieux brouillard mental et ballonnements sous probiotiques Si les probiotiques aggravent les ballonnements ou une sensation de brouillard mental, les arrêter et faire rechercher par un médecin une pullulation bactérienne de l'intestin grêle. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [5]
Pendant une immunothérapie anticancéreuse, seulement en études Clostridium butyricum CBM588 est une piste intéressante, mais pas encore suffisamment testée. Uniquement après en avoir parlé avec l'équipe soignante. Expérimental Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [6]
Immunité affaiblie : demander avant Pendant une chimiothérapie, après une greffe, avec un cathéter veineux central, une maladie grave ou chez les prématurés, demande à l'équipe soignante avant tout probiotique vivant. Le risque est faible, mais réel. Bien étayé Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [7]

Vu de la communauté : ce que rapportent les personnes concernées

Des expériences et des conseils de personnes concernées qui reviennent sans cesse, mais pour lesquels il n’existe pas encore d’études solides. Ce ne sont pas des preuves, et nous le disons clairement.

Préparat de spores – import direct du Japon

Dans les communautés microbiome, SIBO et Covid long revient sans cesse le même conseil : un produit japonais à base de Clostridium butyricum, commandé directement au Japon. Beaucoup rapportent l'avoir introduit progressivement et disent qu'il les a aidés après une cure d'antibiotiques et en cas de problèmes d'histamine. Tout aussi récurrents sont les troubles lors de l'introduction : crampes abdominales à trop forte dose et selles plus molles.

Niveau de preuve : premiers indices très répandu Où cela est rapporté : r/Microbiome (communauté Reddit),r/SIBO (communauté Reddit),r/HistamineIntolerance (communauté Reddit),Phoenix Rising (forum ME/CFS)
Les spores survivent à l'acide gastrique

Très répandue est la thèse que les espèces de Bacillus sporulées traversent l'acide gastrique sans dommage et agissent donc là où les bactéries lactiques échouent. À qui ne tolère pas Lactobacillus ou Bifidobacterium, les forums recommandent presque par réflexe des probiotiques à spores. En même temps, certains rapportent des maux de tête, des crampes et de la diarrhée lors de l'introduction, ce qui est alors classé comme « die-off ».

Niveau de preuve : premiers indices revient régulièrement Où cela est rapporté : r/SIBO (communauté Reddit),r/Microbiome (communauté Reddit),r/Supplements (communauté Reddit),r/Biohackers (communauté Reddit)

Les témoignages peuvent tromper : ce qui aide beaucoup de gens peut être un effet placebo, et ce qui aide l’un peut nuire à l’autre. Prends-les comme des pistes à poser à ton médecin ou à ton pharmacien, pas comme un mode d’emploi.

Envie de quelque chose de complètement différent ? Encore un, au hasard

Comment nous évaluons les preuves

Indice de confiance 5 sur 5 :Établi: Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain.
Indice de confiance 4 sur 5 :Bien étayé: Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants.
Indice de confiance 3 sur 5 :Prometteur: Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes.
Indice de confiance 2 sur 5 :Plausible: Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles.
Indice de confiance 1 sur 5 :Expérimental: Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte.

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