Traitements du SIBO comparés : rifaximine, plantes, alimentation élémentaire et greffe de selles

Antibiotique ou plantes, alimentation liquide spéciale ou greffe de selles : ce que montrent les études sur chaque voie, où les preuves sont minces et ce que rapportent les personnes concernées.

Quelle est la solidité de la recherche ? Plausible

La rifaximine est la mieux étudiée et normalise le test respiratoire chez environ 60 à 70 %, mais le plus souvent dans des études sans groupe témoin. Pour les plantes, l’alimentation élémentaire et la greffe de selles, il n’existe que quelques petites études isolées ou rétrospectives. Comme le succès est presque toujours mesuré par le test respiratoire, imprécis, toutes les comparaisons sont incertaines.

État sain

Le Pullulation bactérienne de l’intestin grêle (SIBO) Trop de bactéries dans l’intestin grêle, où peu vivent normalement. Ballonnements et diarrhée sont typiques ; on la diagnostique en général par un test respiratoire. Plus dans le chapitre « Quand l’intestin grêle est trop colonisé » est traité dans le but de réduire la quantité de bactéries dans l’intestin grêle. Que ce soit réussi se juge presque toujours avec un second Test respiratoire Après avoir bu une solution sucrée, on mesure plusieurs fois l’hydrogène et le méthane dans l’air expiré. Cela révèle des intolérances aux sucres et des signes de pullulation bactérienne. Plus dans le chapitre « Tests intestinaux : ce qu’ils montrent et ce qu’ils ne montrent pas », pas avec un prélèvement dans l’intestin grêle. Un test respiratoire normal est donc une mesure de substitution. Pour toi, l’essentiel est que les troubles s’améliorent et que l’amélioration dure.

La rifaximine est le médicament le mieux étudié. Elle passe à peine de l’intestin dans le sang et agit surtout là où il faut. Dans une Méta-analyse Une analyse qui combine les résultats de plusieurs études. Elle ne vaut que ce que valent les études qu’elle inclut. de 32 études portant sur 1331 personnes, le test respiratoire s’est normalisé chez environ 71 %, avec des effets indésirables chez à peine 5 %. Dans le Syndrome de l’intestin irritable Des douleurs abdominales récurrentes liées aux selles, sans que les examens trouvent une autre cause. On le comprend aujourd’hui comme un trouble de l’interaction intestin-cerveau. Plus dans le chapitre « L’axe intestin-cerveau » sans constipation, la rifaximine a été testée dans de grandes études contre Placebo Un faux traitement sans principe actif. La comparaison avec lui montre ce qu’un remède apporte au-delà de l’attente et du hasard. et aide une partie des personnes concernées.

En cas de méthane au test respiratoire, la rifaximine seule agit moins bien. Dans une analyse rétrospective d’un centre américain, le méthane a disparu chez 28 % avec la rifaximine seule, chez 33 % avec l’antibiotique néomycine seul et chez 87 % avec les deux ensemble.

Les remèdes à base de plantes sont très appréciés des personnes concernées. L’étude la plus citée vient d’une clinique universitaire américaine : 104 personnes au test respiratoire positif ont choisi entre la rifaximine et quatre semaines de préparations végétales mélangées. Le test respiratoire s’est normalisé chez 46 % avec les plantes et chez 34 % avec la rifaximine. La différence peut être due au hasard. Chez les personnes que la rifaximine n’avait pas aidées, il s’est normalisé avec les plantes chez 8 sur 14.

L’ Alimentation élémentaire Boisson nutritive composée d’acides aminés, de sucres simples et de graisses isolés, absorbée dès le haut de l’intestin grêle. Utilisée dans le SIBO pendant deux à trois semaines à la place de toute autre alimentation. remplace pendant deux à trois semaines tous les repas par une boisson nutritive composée d’acides aminés, de sucres et de graisses isolés. Elle est absorbée dès le haut de l’intestin grêle, et les bactéries situées plus loin reçoivent à peine de nourriture. Dans une étude plus ancienne portant sur 93 personnes, le test respiratoire était normal chez 80 % après 15 jours et chez 85 % après 21 jours. Dans une étude plus récente avec 30 personnes et une recette plus agréable au goût, c’était 73 %, et 83 % ont rapporté un net soulagement.

La greffe de selles transfère la Microbiome, microbiote intestinal La communauté de tous les microbes de l’intestin, surtout des bactéries, mais aussi des virus, des champignons et des archées. La plupart vivent dans le côlon. Plus dans le chapitre « Développer la diversité microbienne » d’un donneur en bonne santé. Elle est bien démontrée en cas d’infection récidivante à Clostridioides difficile Une bactérie qui peut se répandre après des antibiotiques et provoquer une diarrhée sévère par ses toxines. Plus dans le chapitre « Après les antibiotiques : C. difficile et la transplantation fécale ». Pour le SIBO, il existe une Essai randomisé Une étude dans laquelle le hasard décide qui reçoit le traitement et qui ne le reçoit pas, pour comparer. Les résultats sont ainsi particulièrement fiables. chinoise de 55 personnes : des gélules de selles de donneur une fois par semaine pendant quatre semaines ont amélioré les troubles plus que des gélules placebo.

Quatre voies contre le SIBO, très inégalement étudiées. C’est pour la rifaximine qu’il y a le plus d’études.

État perturbé : causes et conséquences

Les preuves sont plus faibles que ce que laissent entendre les forums et certains cabinets. Une méta-analyse ultérieure n’a trouvé que 59 % pour la rifaximine et, dans les rares études randomisées, aucun avantage certain par rapport aux traitements de comparaison. Une revue de 2026 relève que les antibiotiques peuvent normaliser les tests respiratoires et soulager les troubles, mais que l’on ignore si cela tient à un effet sur les bactéries de l’intestin grêle.

L’étude sur les plantes a des limites nettes. Elle était rétrospective, le traitement n’a pas été attribué au hasard, les préparations étaient des mélanges de plusieurs plantes, et le groupe rifaximine, avec 34 %, a fait moins bien que dans d’autres études. Sur des substances populaires comme l’allicine de l’ail ou l’huile d’origan, nous n’avons trouvé aucune étude chez des personnes atteintes de SIBO, seulement des essais en laboratoire et sur l’animal. Pour la berbérine, une comparaison avec la rifaximine a été annoncée en 2023 ; nous n’avons pas trouvé de résultats. Une méta-analyse en réseau de 2025 a placé la berbérine en tête, ce que les auteurs eux-mêmes considèrent seulement comme une hypothèse.

Dans les forums circulent des protocoles de plantes avec des doses, des associations et des durées fixes sur de nombreuses semaines. Ils ne sont pas validés, c’est pourquoi nous ne les reproduisons pas ici volontairement. Les produits à base de plantes peuvent avoir des effets indésirables et des interactions, et la teneur et la pureté des compléments alimentaires varient. Plus d’un tiers des personnes atteintes du syndrome de l’intestin irritable utilisent des traitements sans médicaments, comme des produits naturels ou des techniques de relaxation.

Beaucoup de personnes concernées rapportent une aggravation dans les premiers jours d’une cure et l’interprètent comme un « die-off », signe que la cure agit. Il n’existe aucune preuve de cela pour le SIBO. Tout aussi répandue est l’idée qu’il faudrait d’abord « briser » les Biofilm Une communauté de microbes qui adhère à une surface et s'enveloppe d'une gaine protectrice qu'elle fabrique elle-même, comme la plaque dentaire. Plus dans le chapitre « Les biofilms dans l'intestin et les « briseurs de biofilm » ». La seule analyse à ce sujet porte sur 13 personnes d’un seul cabinet.

L’alimentation élémentaire est éprouvante : deux à trois semaines de boisson nutritive uniquement, coûteuse, souvent peu agréable au goût et isolante socialement. Dans les études sur des alimentations élémentaires à boire, jusqu’à 40 % ne les ont pas tolérées, surtout à cause du goût ; cette revue ne portait pas seulement sur le SIBO. Elle ne convient pas en cas de tendance aux troubles du comportement alimentaire. Les études n’avaient pas de groupe témoin, et le fabricant a participé à la plus récente. Les préparations élémentaires faites maison trouvées sur Internet ne sont pas validées.

Les antibiotiques ont un prix. Dans l’étude sur les plantes, le groupe rifaximine a compté une infection à C. difficile et une réaction allergique grave. Les cures répétées favorisent les résistances et modifient la flore du côlon. Et toutes les voies ont le même problème : si la cause persiste, la prolifération revient souvent. La greffe de selles dans le SIBO est expérimentale et relève des études.

Sans recherche de la cause, une cure succède souvent à une autre, et les troubles reviennent.

Ce qui aide souvent

Mode de vie

Alimentation, activité physique, sommeil, liens sociaux et gestion du stress.

Mesurer le succès à tes symptômes Un test respiratoire normal n’est pas la même chose qu’être en bonne santé. Note avant, pendant et après un traitement les ballonnements, la douleur et les selles. Tu verras ainsi si le traitement t’aide vraiment, et tu auras une bonne base pour le prochain rendez-vous médical. Prometteur Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [1]
S’attaquer en parallèle à la cause Tout traitement ne réduit les bactéries que temporairement si la cause persiste. Profite du temps qui suit une cure pour t’occuper des médicaments, de la thyroïde, de la glycémie et des pauses entre les repas. Prometteur Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [2]

Compléments naturels

Les compléments ne remplacent pas un bilan médical. Parle du dosage et des interactions avec ton médecin ou ton pharmacien.

Antimicrobiens végétaux uniquement comme essai accompagné Les mélanges de plantes ont obtenu des résultats proches de la rifaximine dans une étude rétrospective ; en complément du traitement standard, ils n’ont pas davantage réduit les gaz dans une étude randomisée, mais ont peut-être un peu amélioré les troubles. Si tu veux essayer : avec un suivi médical, avec une fin fixée et sans protocoles de forums. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [3][4]
Gomme de guar partiellement hydrolysée avec l’antibiotique Dans une étude randomisée portant sur 77 personnes, le test respiratoire s’est normalisé chez 85 % avec la rifaximine plus cette fibre soluble, contre 62 % avec la rifaximine seule. Il s’agit d’une seule étude, mais cette fibre est bien tolérée. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [5]
Probiotiques plutôt en accompagnement Dans une méta-analyse de petites études, les probiotiques ont réduit les gaz au test respiratoire et un peu soulagé les douleurs abdominales. Les études sont très différentes, et l’on ignore quelle souche aide. Si les ballonnements augmentent, arrête-les. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [6]

Traitements médicaux

Information, pas une recommandation de traitement. Décide avec un médecin. L’autorisation et la disponibilité varient selon les pays.

Rifaximine Le traitement le mieux étudié, le plus souvent pendant une à deux semaines. Dans de nombreux pays, elle n’est pas expressément autorisée pour le SIBO, et les frais ne sont alors pas toujours remboursés. Les rechutes sont fréquentes ; avant une deuxième cure, la recherche de la cause vaut la peine. Prometteur Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [7][8][9]
En cas de méthane : discuter de l’association avec la néomycine Pour un test respiratoire positif au méthane, l’association a nettement mieux fonctionné que la rifaximine seule dans une analyse rétrospective. La néomycine est à peine absorbée, mais peut abîmer l’audition et les reins en cas d’insuffisance rénale ou d’administration prolongée. Uniquement après évaluation médicale. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [10]
Alimentation élémentaire uniquement avec accompagnement Une option quand les antibiotiques n’aident pas ou ne sont pas tolérés. Uniquement avec un suivi médical ou diététique, en surveillant le poids, la glycémie et les nutriments, et pas en cas de troubles du comportement alimentaire. Réintroduire ensuite les aliments de façon ciblée. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [11][12][13]
Greffe de selles : uniquement dans des études Pour le SIBO, il n’existe qu’une seule étude randomisée de 55 personnes. Les selles de donneur peuvent transmettre des agents pathogènes ; ce traitement relève donc de programmes contrôlés ou d’études, jamais de l’initiative personnelle. Expérimental Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [14][15]

Vu de la communauté : ce que rapportent les personnes concernées

Des expériences et des conseils de personnes concernées qui reviennent sans cesse, mais pour lesquels il n’existe pas encore d’études solides. Ce ne sont pas des preuves, et nous le disons clairement.

Les protocoles à base de plantes à la place des antibiotiques ou après eux

Beaucoup rapportent avoir essayé des remèdes à base de plantes — origan, berbérine, allicine, neem — à la place des antibiotiques ou après eux, souvent en s'appuyant sur un protocole répandu d'une praticienne spécialisée connue, le choix dépendant du type de gaz. Il revient souvent que plusieurs cures ont été nécessaires et qu'un même remède a aidé certaines personnes tout en aggravant les symptômes chez d'autres ; sont aussi rapportés des ballonnements plus forts sous allicine. L'usage prolongé et des doses très élevées d'ail ne sont pas anodins.

Niveau de preuve : contradictoire très répandu Où cela est rapporté : r/SIBO (communauté Reddit),Forum Propeciahelp,symptome.ch (forum)
Le régime élémentaire comme dernier essai coûteux

Beaucoup rapportent avoir essayé le régime élémentaire comme dernier recours ; les avis vont de « m'a rendu la vie » à « n'a rien apporté ou m'a mis à plat ». Comme obstacles, ils citent le coût élevé, le goût et le fait que les produits tout prêts sont difficiles à obtenir hors des États-Unis, ce qui pousse certains à les mélanger eux-mêmes.

Niveau de preuve : premiers indices revient régulièrement Où cela est rapporté : Phoenix Rising (forum ME/CFS),r/SIBO (communauté Reddit),Mumsnet (forum de parents),HealthUnlocked IBS Support (forum)
« Dissoudre le biofilm » avant le traitement proprement dit

La conviction est répandue que les bactéries se cachent dans un film protecteur qu'il faudrait d'abord dissoudre avec du NAC, des enzymes ou du bismuth, sans quoi les remèdes n'agiraient pas. Tout aussi répandus sont les témoignages selon lesquels ces remèdes n'ont rien changé chez eux. Des voix expérimentées conseillent de vérifier d'abord la motricité de l'intestin et de ne pas faire des bactéries l'unique ennemi à abattre.

Niveau de preuve : premiers indices revient régulièrement Où cela est rapporté : r/SIBO (communauté Reddit),Bioenergetic Forum
La transplantation fécale réalisée soi-même

Dans certains forums, quelques personnes rapportent s'être administré elles-mêmes une transplantation fécale à domicile, le plus souvent par lavement avec les selles d'un membre sain du foyer ; une personne décrit une nette amélioration après des années d'antibiotiques en continu. Les fils de discussion portent beaucoup sur les risques, le choix du donneur et la question de savoir si cette voie est défendable. Cette voie n'est pas à recommander : les selles transmettent des agents pathogènes comme Giardia, l'hépatite A ou C. difficile, et le donneur n'est pas dépisté pour les agents infectieux.

Niveau de preuve : aucune étude rapporté ponctuellement Où cela est rapporté : HealingWell (forum),J-Pouch.org (forum),Inspire (forums de patients)

Les témoignages peuvent tromper : ce qui aide beaucoup de gens peut être un effet placebo, et ce qui aide l’un peut nuire à l’autre. Prends-les comme des pistes à poser à ton médecin ou à ton pharmacien, pas comme un mode d’emploi.

Envie de quelque chose de complètement différent ? Encore un, au hasard

Comment nous évaluons les preuves

Indice de confiance 5 sur 5 :Établi: Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain.
Indice de confiance 4 sur 5 :Bien étayé: Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants.
Indice de confiance 3 sur 5 :Prometteur: Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes.
Indice de confiance 2 sur 5 :Plausible: Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles.
Indice de confiance 1 sur 5 :Expérimental: Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte.

Sources

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