Ruta de aprendizaje: Para empezar: así funciona tu intestino · Capítulo 3 de 5

Diversidad microbiana

Construir diversidad microbiana

Por qué muchas especies distintas mantienen estable el intestino y cómo reconstruirlo tras los antibióticos.

¿Qué tan sólida es la investigación? Nivel de confianza 3 de 5:Prometedor

Que una baja diversidad va unida a muchas enfermedades está bien observado. Si más diversidad hace más sano de forma específica solo se ha estudiado en pocos ensayos aleatorizados.

¿Causa o consecuencia? Causa de raíz 3 de 5:Causa y consecuencia

La poca diversidad surge de los antibióticos y de una alimentación monótona. Es a la vez la base de la falta de butirato y del crecimiento excesivo de gérmenes.

Estado saludable

Un intestino sano alberga cientos de especies de bacterias. Muchas cumplen funciones parecidas. Si una falta, otra la sustituye, como en un bosque rico en especies. Esta redundancia hace que el ecosistema resista perturbaciones como infecciones, viajes o un cambio de dieta. Los expertos hablan de resiliencia: tras una perturbación, el sistema vuelve a su estado de partida. Cuantas más especies con capacidades que se solapan, más probable es que lo consiga.

Cuando se habla de “diversidad”, se trata de dos cosas. El número de especies (riqueza) indica cuántas especies distintas hay. La uniformidad indica si las proporciones se reparten de forma parecida o una especie lo domina todo. Los estudios suelen resumir ambas en una sola cifra, que solo sirve como guía aproximada para la salud. Lo decisivo suele ser menos la cifra en sí que si las tareas importantes están cubiertas: descomponer fibra, formar Butirato Un ácido graso de cadena corta y la principal fuente de energía de las células de la pared del colon. Refuerza la barrera y frena la inflamación. Más en el capítulo «Butirato y otros ácidos grasos de cadena corta», transformar Ácidos biliares Sustancias que forma el hígado para hacer digerible la grasa. Alrededor del 95 por ciento se recupera en el último tramo del intestino delgado; las bacterias transforman el resto. Más en el capítulo «Ácidos biliares: cuando la bilis causa diarrea», aprovechar el moco con moderación.

Las especies están estrechamente entrelazadas. Las bifidobacterias, por ejemplo, descomponen fibras como la inulina y liberan acetato y lactato. Productores de butirato como Faecalibacterium prausnitzii aprovechan estos productos intermedios y fabrican butirato, que alimenta las células intestinales. Los expertos lo llaman alimentación cruzada (cross-feeding). Si falla un eslabón, sufre toda la cadena.

La diversidad no se limita a las bacterias. En el intestino viven también arqueas (como las productoras de metano), virus, sobre todo Bacteriófagos Virus que solo infectan bacterias. En el intestino hay probablemente tantos fagos como bacterias, quizá más, y ayudan a decidir qué bacterias se imponen. Más en el capítulo «Bacteriófagos: los cazadores del intestino» que infectan bacterias y ayudan a regular su número, y hongos. La comunidad de hongos en personas sanas es poco diversa y está dominada por levaduras como Saccharomyces, Malassezia y Candida; varía mucho de una persona a otra. Si estos grupos importan para la diversidad total aún se investiga; lo seguro es que interactúan con las bacterias.

La diversidad no se forma igual en todas partes. En el estómago y el intestino delgado hay pocos gérmenes por mililitro, porque el ácido gástrico, la bilis, las enzimas digestivas y la ola de limpieza entre comidas (el Complejo motor migratorio Una onda de contracciones que, en ayunas, vacía el estómago y el intestino delgado cada hora y media o dos horas. Comer la interrumpe. Más en el capítulo «Ayuno intermitente y horarios de comida: 16:8, 5:2 y Ramadán») los mantienen bajos. La gran diversidad corresponde al colon, donde el contenido avanza despacio y la fibra llega como alimento. También la Capa de moco Una capa de gel de mucinas sobre la pared intestinal que mantiene a las bacterias a distancia. En el colon, la capa interna está casi libre de gérmenes. Más en el capítulo «La capa de moco y los aditivos» y el sistema inmunitario participan: la IgA (IgA secretora) Anticuerpo de las mucosas. Se libera en gran cantidad al intestino y allí retiene los gérmenes en el moco sin provocar inflamación. Más en el capítulo «IgA: el anticuerpo que mantiene limpio el intestino, y qué tienen que ver la vitamina A, la D y el omega-3» y la mucosa ayudan a decidir quién puede asentarse de forma duradera. La diversidad en las heces es, pues, el resultado de todo un recorrido digestivo, no solo de las bacterias.

FibraBifidobacteriasacetato, lactatoproductoras de butiratoButiratoCélulas intestinalescada especie alimenta a la siguiente
Diversidad es reparto del trabajo: una especie descompone la fibra y la siguiente produce butirato para las células intestinales.

Estado alterado: causas y consecuencias

En los países industrializados la diversidad de la Microbioma, microbiota intestinal La comunidad de todos los microbios del intestino, sobre todo bacterias, además de virus, hongos y arqueas. La mayoría vive en el colon. es menor que en personas con estilo de vida tradicional. Se consideran causas la dieta pobre en fibra, los antibióticos frecuentes y los alimentos muy procesados. Un experimento con ratones muestra que la falta de fibra por sí sola puede hacer mucho: con alimento pobre en fibra, ratones con microbiota humana perdieron cada vez más especies a lo largo de varias generaciones, y estas no volvieron solo con fibra. Faltaban sin más en la población y había que reintroducirlas además. No se puede trasladar tal cual a las personas, pero explica por qué cuesta tanto “realimentar” la diversidad.

Tras un tratamiento antibiótico, algunas especies no vuelven. En tres personas que tomaron ciprofloxacino dos veces, la diversidad cayó claramente en pocos días y en las semanas siguientes se recuperó casi siempre solo en parte; cada persona reaccionó de forma distinta. La baja diversidad se asocia con sobrepeso, Enfermedad inflamatoria intestinal Término que agrupa la enfermedad de Crohn y la colitis ulcerosa: inflamaciones crónicas del intestino, con brotes, que necesitan tratamiento médico. Más en el capítulo «Sistema inmunitario e inflamación» y mayor susceptibilidad a infecciones, aunque causa y efecto a menudo no pueden separarse.

También influyen los medicamentos que no son antibióticos: aproximadamente uno de cada cuatro de los analizados inhibió en el laboratorio el crecimiento de al menos una especie de bacteria intestinal. Los inhibidores de ácido dejan pasar más bacterias de la boca a tramos más profundos y, en un estudio, redujeron la diversidad ya tras cuatro semanas. Los edulcorantes, los Emulgentes Aditivos que mezclan grasa y agua, como la carboximetilcelulosa o el polisorbato 80. Algunos dañan la capa de moco en estudios. Más en el capítulo «La capa de moco y los aditivos» y las toxinas de moho tienen sus propios capítulos.

Algunas tareas solo las dominan unos pocos especialistas, como la transformación de ácidos biliares por ciertos clostridios. Si se pierden, falta la función, aunque el número total de bacterias vuelva a ser normal. La diversidad es, por eso, también un seguro para capacidades poco comunes.

Hay una salvedad importante: más diversidad no siempre es mejor. Con un tránsito intestinal lento, es decir, heces duras y poco frecuentes, a menudo se mide un mayor número de especies, pero la fermentación se desplaza de los hidratos de carbono hacia las proteínas y en la orina aparecen más productos de degradación proteica. Una diversidad alta con estreñimiento no es, por tanto, señal de salud. Una prueba de heces que solo informa de una cifra de diversidad tampoco te dice mucho. Son más útiles los síntomas, el ritmo de las deposiciones y lo que comes.

Las diferencias entre personas son grandes. Los niños construyen su microbiota en los primeros años de vida; las personas mayores suelen perder especies, en parte porque comen con menos variedad. Un año de dieta mediterránea desplazó la microbiota de personas de 65 a 79 años hacia especies asociadas con menos fragilidad.

Fibrafaltaacetato, lactatoproductoras de butiratoButiratoCélulas intestinalesfalta un eslabón, la cadena se rompe
Si falta un eslabón, al final llega menos butirato a las células intestinales.

De dónde viene y adónde lleva

Los mismos síntomas pueden tener raíces distintas. Este mapa muestra qué puede estar implicado en este problema y qué puede derivarse de él.

Posibles causas. Antibióticos, Medicamentos, Protectores (IBP), Acidez y reflujo, Hormonas y ciclo, Long Covid, POTS y tejido conectivo, Deporte de resistencia. Posibles consecuencias. Poca IgA, Oportunistas, Inmunidad intestinal, Poco butirato, Capa de moco fina, Alergias, Biopelículas, Autoinmunidad, Crohn y colitis, Barrera permeable, Piel e intestino, Gastroparesia, Estreñimiento, Digestión débil, Déficit de nutrientes, Ácidos biliares, Cáncer colorrectal, Niebla y agotamiento, Diarrea, Dolor abdominal, Poca DAO, Inflamación, Intolerancias

Hormonas, ciclo e intestinoHormonas y cicloCovid persistente e intestino: cuando el abdomen no se calma tras el coronavirusLong CovidPOTS e hipermovilidad: cuando la circulación y el tejido conectivo arrastran al intestinoPOTS y tejidoconectivoIntestino y deporte de resistencia: intestino del corredor, calambres y qué ayudaDeporte deresistenciaAcidez y reflujoAcidez y reflujoTras los antibióticos: C. difficile y el trasplante fecalAntibióticosMedicamentos que cambian el intestinoMedicamentosProtectores gástricos (IBP): qué cambian en el intestino y cómo dejarlos bienProtectores (IBP)Construir diversidad microbianaPoca diversidadIgA: el anticuerpo que mantiene limpio el intestino, y qué tienen que ver la vitamina A, la D y el omega-3Poca IgAPatógenos oportunistasOportunistasSistema inmunitario e inflamaciónInmunidadintestinalButirato y otros ácidos grasos de cadena cortaPoco butiratoLa capa de moco y los aditivosCapa de moco finaAlergias e intolerancias: cómo aprende el intestino a tolerar la comidaAlergiasBiopelículas en el intestino y los «rompe-biofilm»BiopelículasEnfermedades autoinmunes e intestino: Hashimoto, vitíligo, diabetes tipo 1 y másAutoinmunidadEnfermedad de Crohn y colitis ulcerosa: entender la enfermedad inflamatoria intestinalCrohn y colitisLa barrera intestinalBarrera permeablePiel e intestino: qué hay de cierto en el eje intestino-pielPiel e intestinoGastroparesia: cuando el estómago se vacía demasiado despacioGastroparesiaEstreñimiento: más que poca fibraEstreñimientoÁcido gástrico, bilis y enzimasDigestión débilDeficiencia de nutrientes en problemas intestinales: cuando la comida ya no llegaDéficit denutrientesÁcidos biliares: cuando la bilis causa diarreaÁcidos biliaresIntestino y cáncer: de qué protege la microbiota, qué perjudica y por qué influye en el tratamiento del cáncerCáncercolorrectalNiebla mental y agotamiento: cuando el abdomen cansa la cabezaNiebla yagotamientoDiarrea: entenderla, clasificarla y reaccionar bienDiarreaDolor abdominal y calambres: de dónde viene el dolorDolor abdominalDAO: la enzima que intercepta la histamina de los alimentosPoca DAOAlimentación contra la inflamación silenciosaInflamaciónLactosa, fructosa, gluten: entender bien las intoleranciasIntolerancias
  • Posibles causas
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Relaciones, no certezas: una conexión significa «puede», no «debe». Lo que se aplica a tu caso se aclara mejor hablando con tu médico.

Lo que suele ayudar

Estilo de vida

Alimentación, ejercicio, sueño, relaciones sociales y manejo del estrés.

  • Alimentos fermentados cada día En un ensayo aleatorizado de diez semanas con 36 adultos sanos, varias raciones de fermentados al día aumentaron la diversidad y bajaron 19 marcadores inflamatorios. El objetivo principal fijado de antemano no se alcanzó estadísticamente, así que el estudio es un indicio. Una dieta rica en fibra por sí sola no aumentó la diversidad en ese tiempo. Si eso beneficia la salud a largo plazo está por ver. Prometedor Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [1]
  • Contar la variedad de vegetales Las personas que comían más de 30 vegetales distintos por semana tenían una microbiota más diversa que quienes comían 10 o menos. Es una asociación, no una prueba. Puedes contar con generosidad: también hierbas, frutos secos, semillas y especias. Plausible Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [2]
  • Pasar tiempo con otras personas Las bacterias intestinales se transmiten entre personas que tienen mucho contacto entre sí. Plausible Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [3]
  • Dieta de tipo mediterráneo durante meses Un año de dieta mediterránea desplazó la microbiota de personas mayores hacia especies asociadas con menos fragilidad y menor inflamación. Eso muestra que a edad avanzada aún es posible cambiar algo, pero requiere paciencia. Prometedor Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [4]
  • Aumentar la fibra despacio y desde muchas fuentes Sube la cantidad poco a poco a lo largo de semanas y alterna las fuentes (legumbres, cereales integrales, verduras, frutos secos, semillas). Fibras distintas alimentan especies distintas. Con un intestino sensible, ayudan al principio las raciones pequeñas y los alimentos bien cocidos. Prometedor Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [5]

Suplementos naturales

Los suplementos no sustituyen una consulta médica. Comenta la dosis y las interacciones con tu médico o farmacéutico.

  • Probióticos con prudencia El efecto depende mucho de la cepa. La sociedad estadounidense AGA solo recomienda ciertas cepas para proteger frente a C. difficile durante los antibióticos y no ve pruebas suficientes para el colon irritable. Tras los antibióticos, en un estudio pequeño los probióticos incluso retrasaron la vuelta de la propia microbiota. Prometedor Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [6][7]
  • Fibra soluble La cáscara de psyllium o la inulina pueden aumentar el aporte de fibra. La inulina causa mucha hinchazón a algunas personas. Prometedor Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [8]

Tratamientos médicos

Información, no una recomendación de tratamiento. Decide junto con un médico. La autorización y la disponibilidad varían según el país.

  • Usar los antibióticos con criterio Aclara con tu médico si de verdad los necesitas y, en ese caso, completa el tratamiento. Bien respaldado Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto.
  • Revisar los inhibidores de ácido y otros fármacos de uso prolongado Si tomas inhibidores de ácido u otros fármacos de forma continuada, puedes preguntar en la próxima revisión si dosis y duración siguen siendo necesarias. No los suspendas por tu cuenta: algunos protegen frente a complicaciones graves. Prometedor Cómo valoramos la evidencia Consolidado Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas. Bien respaldado Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes. Prometedor Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes. Plausible Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias. Experimental Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto. [9]

¿Te apetece algo completamente distinto? Otro más, al azar

Cómo valoramos la evidencia
Nivel de confianza 5 de 5:Consolidado
Recomendado en guías clínicas o respaldado por varios metaanálisis coincidentes de estudios aleatorizados en personas.
Nivel de confianza 4 de 5:Bien respaldado
Varios estudios aleatorizados en personas con resultados mayoritariamente coincidentes.
Nivel de confianza 3 de 5:Prometedor
Estudios aleatorizados o controlados aislados en personas, aún no confirmados de forma independiente, o muchos estudios observacionales coincidentes.
Nivel de confianza 2 de 5:Plausible
Dos casos: primeros estudios observacionales o piloto con muestras pequeñas, o una base asentada y no discutida, como el movimiento, el sueño o las pausas entre comidas. Pero no probado en personas para las molestias.
Nivel de confianza 1 de 5:Experimental
Apenas estudiado en personas. Sobre todo estudios de laboratorio y en animales o consideraciones teóricas; si ayuda, está abierto.

Fuentes

  1. Wastyk et al. 2021: Los alimentos fermentados aumentan la diversidad y reducen los marcadores inflamatorios (Cell)
  2. McDonald et al. 2018: American Gut Project, más de 30 plantas por semana (mSystems)
  3. Beghini et al. 2025: Los contactos sociales comparten cepas de bacterias intestinales (Nature)
  4. Ghosh et al. 2020: NU-AGE, un año de dieta mediterránea en personas mayores (Gut)
  5. Reynolds et al. 2019: Calidad de los hidratos de carbono y salud, metaanálisis (Lancet)
  6. Su et al. 2020: Guía de la AGA sobre probióticos en trastornos gastrointestinales (Gastroenterology)
  7. Suez et al. 2018: Los probióticos retrasan la recuperación del microbioma tras los antibióticos (Cell)
  8. Lacy et al. 2021: Guía clínica del ACG sobre el síndrome del intestino irritable (American Journal of Gastroenterology)
  9. Seto et al. 2014: Los protectores gástricos durante 28 días reducen la diversidad microbiana (Microbiome)
  10. Belenguer et al. 2006: dos vías de alimentación cruzada entre bifidobacterias y productoras de butirato, estudio de laboratorio (Applied and Environmental Microbiology)
  11. Revisión 2025: Clostridium scindens, una especie clave para el metabolismo de los ácidos biliares en el intestino (FEMS Microbiology Reviews)
  12. Lozupone et al. 2012: Diversidad, estabilidad y resiliencia de la microbiota intestinal humana, revisión (Nature)
  13. Nash et al. 2017: La comunidad de hongos intestinales de personas sanas es poco diversa y está dominada por levaduras, 317 muestras de heces (Microbiome)
  14. Revisión 2024: El fagoma humano en distintas partes del cuerpo (Applied and Environmental Microbiology)
  15. Sonnenburg et al. 2016: Una dieta pobre en fibra provoca una pérdida irreversible de especies a lo largo de generaciones, estudio en ratones (Nature)
  16. Dethlefsen y Relman 2011: Tras dos ciclos de ciprofloxacino la microbiota a menudo se recuperó solo de forma incompleta, 3 personas (PNAS)
  17. Maier et al. 2018: Uno de cada cuatro fármacos no antibióticos inhibe bacterias intestinales en el laboratorio (Nature)
  18. Roager et al. 2016: El tiempo de tránsito colónico se relaciona con la composición, la diversidad y el metabolismo de la microbiota (Nature Microbiology)

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