Covid long et intestin : quand le ventre ne se calme pas après le coronavirus

Diarrhée, ballonnements et intestin irritable après une infection au coronavirus : ce que montrent les études de cohorte, ce que pourraient signifier des restes de virus dans l’intestin et quels traitements ont été testés jusqu’ici.

Quelle est la solidité de la recherche ? Plausible

Que des troubles digestifs et un intestin irritable surviennent plus souvent après la covid, de grandes cohortes le montrent, même si les chiffres varient. Des restes de virus dans le tissu intestinal et une flore intestinale modifiée ont été mis en évidence ; savoir s’ils causent les troubles reste ouvert. Pour le traitement, il n’existe jusqu’ici qu’une seule étude positive de taille notable, avec un synbiotique ; la plupart des autres pistes ne sont pas testées ou ont échoué dans les études.

Cause ou conséquence ? Cause et conséquence

Après une infection, des troubles persistent souvent. L’infection est le point de départ ; ses conséquences peuvent ensuite avoir à leur tour des effets.

État sain

Le coronavirus SARS-CoV-2 n’attaque pas seulement les voies respiratoires, il peut aussi se multiplier dans la muqueuse de l’intestin. C’est pourquoi beaucoup de personnes ont aussi, en phase aiguë, de la diarrhée, des nausées ou des douleurs au ventre. Dans une étude de Stanford, du matériel génétique du virus a été retrouvé dans les selles d’environ la moitié des personnes infectées dès la première semaine.

Chez la plupart, cela s’estompe en quelques jours à quelques semaines. La muqueuse se renouvelle, le système immunitaire fait le ménage, et la Microbiome, microbiote intestinal La communauté de tous les microbes de l’intestin, surtout des bactéries, mais aussi des virus, des champignons et des archées. La plupart vivent dans le côlon. Plus dans le chapitre « Développer la diversité microbienne » retrouve son équilibre. Dans une cohorte de Hong Kong, la flore intestinale des personnes complètement rétablies ressemblait de nouveau, au bout de six mois, à celle de personnes sans covid.

L’Organisation mondiale de la santé parle d’affection post-covid-19 lorsque, environ trois mois après l’infection, des symptômes persistent pendant au moins deux mois et ne s’expliquent pas autrement. L’épuisement, l’essoufflement et les problèmes de concentration sont fréquents ; des troubles digestifs peuvent en faire partie.

Après l’infection, le système immunitaire élimine le virus de la muqueuse intestinale et la flore intestinale se rétablit.

État perturbé : causes et conséquences

Dans une cohorte américaine de plus de 150 000 personnes après la covid et de millions de personnes de comparaison, de nouvelles maladies digestives sont survenues plus souvent dans l’année suivant l’infection : reflux, dyspepsie fonctionnelle, troubles intestinaux fonctionnels, pancréatite, maladies du foie et de la vésicule biliaire. Le risque augmentait avec la gravité de la maladie aiguë, mais existait aussi après des formes sans hospitalisation.

Comme après d’autres infections intestinales, un Syndrome de l’intestin irritable Des douleurs abdominales récurrentes liées aux selles, sans que les examens trouvent une autre cause. On le comprend aujourd’hui comme un trouble de l’interaction intestin-cerveau. Plus dans le chapitre « L’axe intestin-cerveau » peut apparaître (voir Intestin irritable après une infection). Dans une étude italienne portant sur des personnes hospitalisées, 3,2 pour cent avaient un nouvel intestin irritable un an après la covid, contre 0,5 pour cent sans covid. Les Méta-analyse Une analyse qui combine les résultats de plusieurs études. Elle ne vaut que ce que valent les études qu’elle inclut. arrivent à environ 12 pour cent, mais ne s’accordent pas sur le fait que ce soit plus qu’après d’autres infections. L’anxiété et la dépression augmentaient nettement le risque.

Une piste très discutée est celle des restes de virus dans l’intestin. Chez 14 personnes sans symptômes, des chercheurs ont retrouvé, quatre mois après l’infection, chez la moitié, du matériel génétique et des protéines du virus dans des prélèvements de l’intestin grêle. À Innsbruck, chez 46 personnes atteintes d’une Maladie inflammatoire chronique de l’intestin Terme qui regroupe la maladie de Crohn et la rectocolite hémorragique : des inflammations durables de l’intestin, évoluant par poussées, qui doivent être traitées médicalement. Plus dans le chapitre « Système immunitaire et inflammation », sept mois après une covid légère, 32 avaient du matériel génétique du virus et 24 des protéines du virus dans la muqueuse ; les symptômes post-covid concernaient surtout celles qui avaient ces restes. Aucun virus capable de se multiplier n’a pu être cultivé. Un suivi à deux ans décrit que les restes et les troubles avaient de nouveau disparu.

Dans les selles aussi, du matériel génétique du virus persiste parfois longtemps : dans l’étude de Stanford, chez 12,7 pour cent après quatre mois et chez 3,8 pour cent après sept mois, alors que plus rien n’était détectable dans la gorge. Les personnes qui en avaient dans les selles avaient plus souvent des douleurs au ventre, des nausées et des vomissements. Si ces restes provoquent des troubles ou ne sont que des vestiges, ce n’est pas élucidé.

La flore intestinale change aussi. Dans la cohorte de Hong Kong, les personnes avec un covid long avaient au bout de six mois moins de bactéries productrices de Butyrate Un acide gras à chaîne courte et la principale source d’énergie des cellules de la paroi du côlon. Il renforce la barrière et freine l’inflammation. Plus dans le chapitre « Le butyrate et les autres acides gras à chaîne courte » comme Faecalibacterium prausnitzii et Bifidobacterium pseudocatenulatum, et plus de Ruminococcus gnavus. C’est une association, pas la preuve d’une cause.

Là où règne l’incertitude, les offres coûteuses fleurissent : lavage du sang, séries de perfusions, longues cures d’antibiotiques ou d’antiviraux, analyses de selles spéciales avec plan de traitement. Dans un essai en double aveugle, l’échange plasmatique n’a pas fait mieux qu’un traitement simulé, et une cure de 15 jours d’antiviral nirmatrelvir/ritonavir n’a pas amélioré les troubles.

Chez certaines personnes, des restes de virus demeurent dans le tissu et les bactéries productrices de butyrate manquent. Si cela explique les troubles, c’est ouvert.

D’où cela vient et où cela mène

Les mêmes symptômes peuvent avoir des racines différentes. Cette carte montre ce qui peut être en cause dans ce problème et ce qui peut en découler.

Causes possibles
Ce problème
Conséquences possibles

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Des liens, pas des certitudes : un lien veut dire « peut », pas « doit ». Pour savoir ce qui s’applique à toi, parles-en avec ton médecin.

Ce qui aide souvent

Mode de vie

Alimentation, activité physique, sommeil, liens sociaux et gestion du stress.

L’aborder comme un intestin irritable post-infectieux Les troubles après la covid ressemblent à ceux qui suivent d’autres infections intestinales. Ce qui est démontré pour l’intestin irritable est un point de départ raisonnable : repas réguliers, fibres solubles comme le psyllium, et si besoin une phase limitée dans le temps de régime pauvre en FODMAP avec accompagnement. Des études spécifiquement après la covid font défaut. Prometteur Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [1]
Gérer son énergie Si tu t’effondres pendant des jours après un effort, mieux vaut doser l’activité en petites portions avec des pauses plutôt que de serrer les dents, et en parler au médecin. Cette recommandation repose sur l’expérience des soins, pas sur une étude vérifiée ici. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte.
Manger varié plutôt que faire des cures Il n’existe pas de régime éprouvé pour reconstruire la flore intestinale après la covid. La diversité des végétaux, les fibres selon la tolérance et les aliments fermentés sont les bases générales. Les régimes d’exclusion stricts sans raison nuisent plutôt, car ils réduisent la diversité. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte.

Compléments naturels

Les compléments ne remplacent pas un bilan médical. Parle du dosage et des interactions avec ton médecin ou ton pharmacien.

Synbiotique : un premier essai positif Dans un essai en double aveugle portant sur 463 personnes à Hong Kong, un mélange de bactéries et de fibres (SIM01) pris pendant six mois a amélioré plus souvent que le placebo l’épuisement, les problèmes de mémoire et de concentration, les troubles digestifs et le malaise général. La préparation a été mise au point par l’équipe de recherche elle-même, une confirmation indépendante manque, et cela ne se transpose pas à d’autres produits. Plausible Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [2]

Traitements médicaux

Information, pas une recommandation de traitement. Décide avec un médecin. L’autorisation et la disponibilité varient selon les pays.

Écarter d’autres causes De nouveaux troubles digestifs après la covid ne sont pas automatiquement un covid long ; les études montrent aussi plus de reflux et de problèmes de vésicule biliaire et de pancréas. En cas de perte de poids, de sang dans les selles, de fièvre, de troubles nocturnes, de jaunisse ou de nouveaux troubles après 50 ans, faire examiner par un médecin, de même que la maladie cœliaque, la thyroïde et les marqueurs d’inflammation. Bien étayé Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [3][1]
Prudence avec les protocoles coûteux Le lavage du sang, les séries de perfusions, les longues cures d’antibiotiques ou d’antiviraux et les analyses de selles spéciales avec plan de traitement ne sont pas démontrés pour le covid long. L’échange plasmatique et un antiviral n’ont apporté aucun bénéfice dans des études contrôlées. Il est plus judicieux de consulter une consultation post-covid ou de participer à une étude, là où cela existe. Bien étayé Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [4][5]
L’accompagnement psychologique comme un élément parmi d’autres L’anxiété et la dépression augmentaient nettement le risque d’intestin irritable après la covid. La psychothérapie centrée sur l’intestin aide dans l’intestin irritable avec de bonnes preuves, même si elle n’a pas été testée spécifiquement après la covid. Cela ne veut pas dire que les troubles sont imaginaires. Prometteur Comment nous évaluons les preuves Établi Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain. Bien étayé Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants. Prometteur Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes. Plausible Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles. Expérimental Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte. [6][7]

Vu de la communauté : ce que rapportent les personnes concernées

Des expériences et des conseils de personnes concernées qui reviennent sans cesse, mais pour lesquels il n’existe pas encore d’études solides. Ce ne sont pas des preuves, et nous le disons clairement.

Reconstruire l'intestin après des antibiotiques

Beaucoup rapportent que leur intestin s'est effondré après des cures d'antibiotiques et qu'ils ont passé des mois à le reconstruire avec des probiotiques, des fibres et des préparations pour la barrière intestinale. Certains disent que cela a nettement amélioré les symptômes, d'autres rapportent le contraire et se plaignent d'une intolérance à certaines bactéries lactiques. Le rapport entre antibiotiques et reconstruction de l'intestin est discuté de façon contradictoire dans les forums.

Niveau de preuve : premiers indices revient régulièrement Où cela est rapporté : r/covidlonghaulers (communauté Reddit),r/LongCovid (communauté Reddit)
L'histamine et les mastocytes comme explication

De nombreuses personnes concernées rapportent que leurs problèmes intestinaux s'accompagnent d'un excès d'histamine et d'une activation des mastocytes, visibles par des flushs, des nausées et des réactions à de nombreux aliments. Est souvent décrite une combinaison d'alimentation pauvre en histamine, d'antihistaminiques et de stabilisateurs de mastocytes, avec un succès mitigé. Une partie considère l'intestin comme une conséquence et non comme un déclencheur.

Niveau de preuve : contradictoire revient régulièrement Où cela est rapporté : r/covidlonghaulers (communauté Reddit),r/MCAS (communauté Reddit),Help for Long Covid (témoignages de patients)
Des restes de virus dans l'intestin comme thèse centrale

Beaucoup rapportent la conviction que le Covid long est entretenu par des virus ou des restes de virus demeurés dans l'intestin, et en déduisent des mesures comme le jeûne, certains compléments alimentaires ou des approches « antivirales ». Cette interprétation est transmise comme un modèle personnel et s'appuie sur quelques indices de recherche ; les preuves d'un bénéfice thérapeutique manquent. Un jeûne prolongé peut être dangereux chez les personnes affaiblies.

Niveau de preuve : aucune étude revient régulièrement Où cela est rapporté : r/covidlonghaulers (communauté Reddit),r/LongCovid (communauté Reddit)

Les témoignages peuvent tromper : ce qui aide beaucoup de gens peut être un effet placebo, et ce qui aide l’un peut nuire à l’autre. Prends-les comme des pistes à poser à ton médecin ou à ton pharmacien, pas comme un mode d’emploi.

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Comment nous évaluons les preuves

Indice de confiance 5 sur 5 :Établi: Recommandé dans les recommandations médicales ou soutenu par plusieurs méta-analyses concordantes d’études randomisées chez l’humain.
Indice de confiance 4 sur 5 :Bien étayé: Plusieurs études randomisées chez l’humain aux résultats largement concordants.
Indice de confiance 3 sur 5 :Prometteur: Quelques études randomisées ou contrôlées chez l’humain, pas encore confirmées de façon indépendante – ou de nombreuses études observationnelles convergentes.
Indice de confiance 2 sur 5 :Plausible: Deux cas : premières études observationnelles ou pilotes avec de petits effectifs – ou une base établie et non contestée, comme le mouvement, le sommeil ou les pauses entre les repas. Mais non testé chez l’humain pour les troubles.
Indice de confiance 1 sur 5 :Expérimental: Très peu étudié chez l’humain. Surtout des études en laboratoire et sur l’animal ou des réflexions théoriques ; l’utilité reste ouverte.

Sources

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